项目简介：半抗原-抗体数据量高速增长，构建库容量大、关联性强且具有自主知识产权的专业数据库具有重要的现实意义和实际应用价值。为此，中国农业大学动物医学院沈建忠院士团队王战辉教授课题组联合华南农业大学、郑州大学、河南农业大学、华中农业大学、大连理工大学、河北农业大学、浙江大学、中国疾病预防控制中心、中国农业科学院、重庆探生科技有限公司共同参与数据收集，创建了目前全球唯一可公开访问的半抗原-抗体专业数据库—iHaptenAb。
数据库面向半抗原理性设计、抗原合成、抗体发现与计算化学需求，集成数据浏览、可视化和查询检索3大模块，可支持已报道半抗原查询、量子化学优化结构获取、分子参数下载、抗体性能比对及构效关系研究。平台已收集589个小分子化合物靶标相关的3158个半抗原与相应的2090株抗体数据，构建可迭代、可学习、可扩展的智能专业数据库，为食品安全、环境监测、毒品疫苗、医学诊断等领域提供一站式数据平台支撑。
网址：http://ihaptenab.com
项目背景
半抗原-抗体被广泛应用于食品安全、环境监测、毒品疫苗、医学诊断等领域。随着AI与机器学习的应用日益广泛，对高质量、标准化、易获取的半抗原抗体数据需求愈发迫切。此外，构建半抗原-抗体数据库有助于总结分析专业领域内已产生的相关海量数据，推进领域研究发展。当前半抗原-抗体研究积累的丰富数据，为高质量和高价值半抗原-抗体数据库的构建奠定了良好基础。然而，目前仅报道了两个半抗原数据库（HaptenDB和SuperHapten），且均已不能正常访问，同时两者还存在数据更新不及时、库容量小、数据关联性不强造成数据孤岛等明显不足。为填补这一空白，本研究团队构建了iHaptenAb半抗原-抗体专业数据库，旨在打造一个库容量大、关联性强、功能全面且开放共享的一站式半抗原-抗体研究平台，实现从半抗原设计到抗体应用完整工作流程的可追溯。
内容介绍
1 数据规模与主要内容
数据库涵盖靶标（589个）、免疫半抗原（1678个）、免疫原（1900个）、抗体（2090个）、包被半抗原（1480个）、包被原（1614个）、免疫分析（6718条）、参考文献（1060篇）共8类实体，总条目数可达17129。
数据库主要内容包括靶标名称和标识符（PubChem CID 和 CAS等）、靶标和半抗原的化学结构（量子化学优化三维结构）、靶标和半抗原的计算性质（结构性质、物理化学性质和量子化学性质）、半抗原设计策略（间隔臂和活性基团）、偶联信息（载体蛋白和偶联比）、抗体表征（IC50、交叉反应和稳定性）、分析性能（检测限或Cut-off值）、文献来源，总特征维度可达161。
表1. iHaptenAb数据库统计数据
2 核心功能模块
2.1 数据浏览和详情展示
浏览模块可实现快速查看数据库中所有靶标、半抗原、抗原、抗体和参考文献。页面采用经典的双栏布局：左侧的交互式筛选面板可提供基于属性的筛选选项，而右侧的主数据展示区域则以列表形式呈现筛选结果。默认情况下，条目按ID标识符升序排列，靶标和半抗原还可提供二维结构预览。
图1. iHaptenAb数据库浏览页面
点击ID标识符字段，可进入专属实体详情页面，查看更详细的结构信息、计算性质、相关实体数据、文献来源及基于相似性计算的类似结构。
图2. iHaptenAb数据库详情页面
2.2 数据检索
用户可以在页面右上角通过iHaptenAb 标识符（靶标 ID、半抗原 ID、抗原 ID 或抗体 ID）或靶标名称快速检索以访问相应实体的详情页面。此外，本平台也支持通过Query Build实现高级检索功能，用户可以使用布尔运算符（AND、OR、NOT）组合不同实体的多个属性，从而执行复杂检索。靶标和半抗原提供基于结构匹配和相似性的结构检索。高级检索结果统一重定向到相应靶标的浏览页面，但详情页面中为筛选后的相关实体。
图3. iHaptenAb数据库高级检索功能
2.3 数据可视化
为了直观展示iHaptenAb数据库，本平台为靶标、免疫半抗原、抗体和参考文献4类实体生成对应数据可视化图表。每个图表都附有简短文字说明，用户可通过点击实现与图表交互。此外，数据库中各实体间的拓扑关系可通过网络功能进行可视化，点击任意节点可打开相应实体的详情页面。
图4. iHaptenAb数据库可视化
3 平台发展规划
iHaptenAb数据库定位为社区驱动的开放共享平台，目前已提供数据提交界面（需注册登录），数据提交的完整标准操作流程（SOP）将后续发布，敬请关注。我们诚邀广大研究同行积极试用iHaptenAb数据库，并欢迎提出改进建议。全球研究同行的数据贡献对于构建开放与协作的研究生态至关重要，期待各位积极提交新数据。所有用户提交的条目需经过专家人工审核和批准，确保数据质量。
未来，iHaptenAb将进一步扩展数据维度，纳入更多抗体序列、抗体结构和抗体耐受性功能数据等信息，推动数据库的持续迭代与标准化发展，最终打造成为半抗原-抗体研究领域的综合性数据资源平台。
网址链接: http://ihaptenab.com
指导教师：王战辉 教授
“绿色生态农业论坛”暨国家现代农业与···
芯片育种公司双绿源获隆平生物数千万元···
祝贺！联盟成员周俭民研究员获2023···
华中农大张启发院士/南京农大万建民院···
祝贺！联盟成员董莎萌教授
联盟秘书长张兴平博士在第七届国际瓜类···